یک آکواریوم سالم و متعادل برای تجزیه مواد زائد ماهی ، مواد گیاهی مرده و سایر بقایای آلی تجمع یافته در مخزن به باکتری های مفید متکی است. باکتری آب را کاملاً شفاف نگه داشته و از تجمع آمونیاک سمی و نیتریت جلوگیری می کنند.

این باکتری ها در محیط فیلتر و روی سطح جامد آکواریوم مانند شن ، سنگ ، گیاهان و تزئینات زندگی می کنند ، اما استقرار آنها به زمان نیاز دارد.