از باکس قرنطینه می توان برای نگهداری ماهی باردار یا ماهی آسیب دیده درون خود محیط آکواریوم استفاده کرد. معمولا باکس های قرنطینه بدنه شفافی دارند که می توان ماهی را به خوبی مشاهده کرد.